中日韓首脳会議の歴史は、1999年11月28日に、中国の朱鎔基首相、日本の小渕恵三首相、韓国の金大中大統領がフィリピンのマニラで行った初の首脳会議に遡ることができます。中日韓首脳会議は2008年までにASEAN・東南アジア諸国連合首脳会議に合わせて開かれました。2008年6月に東京で開催された中日韓外相会議で、初の中日韓首脳会議を同年9月に神戸で開催することが決定されました。しかし、日本の福田康夫首相が10月に突然辞任したため、日本側の求めに答えて2008年12月13日に福岡県太宰府市で行われることになりました。以降、中国の北京と韓国の済州島で第２と第3回の首脳会議が行われました。